Стандартные сообщения системы (desktop)

Для работы уведомлений необходим пакет libnotify-bin

notify-send "Hello world!" "This message from system." -i system

Параметр -i system задает иконку сообщения (в примере - иконка системы).

Если надо, чтоб работало из cron, то необходимо сделать пакетный скрипт примерно такого содержания (в примере вывод времени):

#!/bin/sh
eval "export $(egrep -z DBUS_SESSION_BUS_ADDRESS /proc/$(pgrep -u $LOGNAME gnome-session)/environ)";
notify-send "`date +%H:%M`" -i clock